Los enclaves de máximo interés florístico de la sierra de Aralar son:
1. Umbría del cordal que une las estribaciones orientales de Hirumugarrieta (Intza) y Aldaon (Gaintza) entre 1250 y 1380 m. En las fisuras, rellanos y grietas de estos cantiles y al pie de los mismos se localizan las dos especies incluídas en el catálogo de la Flora amenazada de Navarra ( Carex caudata, Anemone pavoniana y Draba dedeana) y otras dos que aparecen citadas en Navarra sólo en estos puntos. Hay también diversas especies consideradas muy raras en Navarra.
2. En Altxueta ( cumbre y laderas de1300 -1340 m pertenecientes a Uharte Arakil), en Putterri (1200-1290 m ,en Ergoien) y Unakopuntzua (1180 m. en el Realengo) se localizan especies muy raras.
3. En Errenaga (1200 m. en el Realengo), Txemiñe (1200 m., en el Realengo) y Balerdi (750 m-1200 m., en Azkarate y Uztegi) se localizan especies con distintos grados de rareza y endemicidad.